Dans son rapport annuel sur la Sécurité sociale, la Cour des comptes estime que les dépenses dynamiques liées aux ALD devraient être analysées et « mieux maîtrisées ». Ce poste a progressé en moyenne de 3,4 % par an entre 2005 et 2013 (pour atteindre 89 milliards d'euros, soit 61 % des dépenses maladie) sous l'effet de la croissance conjuguée du nombre de patients concernés (11,3 millions de personnes) et du coût des traitements.