Le virus Zika pourrait se transmettre par voie sexuelle de façon exceptionnelle. L'OMS indique un cas possible de transmission sexuelle, décrit en 2008 au sein d'un couple mais sans que le virus ait été formellement identifié. Deuxième argument, un résident de Tahiti exposé lors de l'épidémie en Polynésie en 2013 continuait à présenter un niveau viral élevé dans son sperme, deux mois après les symptômes de l'infection et après la disparition totale du virus dans le sang.